¿Qué es una percepción impositiva?

Te toca aplicar una percepción cuando ARCA o la provincia correspondiente te designó formalmente como agente de percepción para esa jurisdicción o ese impuesto, no es algo que decidís vos, es una designación. La percepción se calcula sobre el monto neto gravado de la venta (sin IVA) y se agrega como un concepto adicional en la misma factura, con su propia alícuota.

En el caso de Ingresos Brutos, la alícuota de percepción depende del padrón que publica cada provincia para el CUIT del comprador: puede variar según si el comprador está inscripto o no en esa jurisdicción, y si no figura en el padrón corresponde aplicar la alícuota más alta.

Una mayorista con sede en Santa Fe, designada agente de percepción de Ingresos Brutos, le factura $100.000 más IVA a un cliente de otra provincia. Según el padrón, le corresponde una percepción del 3%: la mayorista suma $3.000 a la factura. El cliente paga el total con la percepción incluida, y esos $3.000 los va a poder tomar como pago a cuenta cuando liquide su propio Ingresos Brutos.

La percepción que le cobrás a tu cliente no es plata tuya: es un anticipo de un impuesto que después tenés que declarar y depositar al fisco a nombre de tu cliente. Registrarla bien en la factura, con su base, su alícuota y su jurisdicción, es lo que le permite a tu cliente tomarla como crédito más adelante, así que un error ahí genera reclamos.